Ai sensi dell’art. 4 del Regolamento di organizzazione dell’Agenzia di cui al DPCM del 7 agosto 2015, l’Agenzia per la coesione territoriale si articola in due Aree di livello dirigenziale generale, 19 Uffici di livello dirigenziale non generale, di cui 5 Uffici di Staff al Dg, a due dei quali sono attribuite le funzioni di Autorità di Gestione dei Programmi Operativi Nazionali affidati all’Agenzia (PON Governance e Capacità Istituzionale, PON Città Metropolitane). Le due Aree di livello dirigenziale generale sono: Area Programmi e Procedure, Area Progetti e Strumenti.